北京大學民營經濟研究院是在我國著名經濟學家厲以寧教授的倡議下于2005年7月28日成立的校級研究機構。香港中小企業國際交流協會為研究院提供了建院的啟動資金。

       北京大學民營經濟研究院正是為了適應形勢發展的需要而成立的，“研究民營經濟發展，促進民營企業騰飛”是研究院的建院宗旨。厲以寧教授對中國民營經濟政策方針的出臺和民營經濟理論研究起到了非常重要的推動作用。從2003年開始，厲以寧教授領導全國政協"民營經濟調查組"對遼寧省、廣東省以及多個省市的民營企業作了大量的調查，匯成《關于促進非公有制經濟發展的幾點建議》的報告。2004年2月，溫家寶總理在這份報告上作了重要批示，建議針對促進非公經濟發展形成一個政策性指導文件。2005年1月，國務院常務會議正式通過《關于鼓勵支持和引導非公有制經濟發展的若干意見》（俗稱“非公經濟36條”）。

       北京大學民營經濟研究院集中了一批以厲以寧教授為代表的有著深厚造詣的學者，并有一批北大校內跨部門、跨學科的中青年學術骨干承擔研究任務。研究院與全國工商聯及政府各部門的民營企業管理機構保持經常性的工作關系，研究院還邀請國內外知名學者以及著名民營企業家作為特邀研究員或顧問。