福建師范大學數學與計算機科學學院的歷史可追溯至1907年建立的福建優級師范學堂的數學專業。1996年成立計算機科學系，與原有的數學系合稱為福建師范大學數學系、計算機科學系，2002年12月成立數學與計算機科學學院。 學院現有數學與應用數學、信息與計算科學、計算機科學與技術、電子信息科學與技術4個全日制本科專業和數學、計算機應用2個函授本科專業，以及計算機科學與技術網絡本科專業。有函數論、代數、幾何、微分方程、概率統計、中數、信息與計算科學、軟件工程、計算智能、軟件理論與圖形圖像、體系結構、網絡與信息安全等教研室

　　建國以后，福建協和大學、華南女子文理學院、福建省立師范專科學校、福建省研究院、福建學院等單位經過調整合并成立福建師范學院，保留發展了數學系。1972年改名為福建師范大學數學系，1985年創辦計算機科學與技術本科專業， 　　1953年以來，數學系先后由王邦珍、王石生、林辰、謝暉春、陳世基、倪守平、薛衛民教授任系主任;吳子文教授任系主任、院長。現任院長李永青教授、院黨委書記楊金輝同志。學院已為國家共培養了一萬多名本、專科生和一百多名研究生。他們走上工作崗位后，積極工作、奮發向上，對社會作出了應有的貢獻。有的成為本省中學工作或基礎教育的骨干，有的成為地方的黨政領導干部，有的成為各級工商、金融、稅務、公司等企事業單位的管理人員和電腦開發人才。 　　主辦面向全國的《福建中學數學》雜志。1983年獲基礎數學、概率論與數理統計2個碩士學位授權點，2000年獲應用數學碩士學位授權點，2006年獲基礎數學博士學位授權點、數學一級學科碩士學位授權點、計算機軟件與理論、計算機應用技術碩士學位授權點，同時，另有數學博士后科研流動站1個。全院現有各類在校本科生及研究生4000多人。 　　學院現有在職教職工152人，專任教師123人，其中教授19人，副教授31人，有博士后經歷8人，具有博士學位52人，在讀博士13人，博士研究生導師5人，碩士研究生導師36多人。有7人入選國家級、省級“百千萬人才工程”，有7人被評為校優秀中青年教師，1人被評為省優秀中青年骨干教師，1人被評為省優秀教師，有4人獲政府特殊津貼。 　　學院現有福建省高校網絡安全與密碼技術重點實驗室和省級計算機實驗教學示范中心。 　　概率統計曾為省重點學科，2005年起基礎數學為省重點學科。曾獲國家科技進步二等獎1項，教育部科技進步二等獎1項，建設部科技進步一等獎、二等獎各1 項，航天部科技進步二等獎1項，交通部科技進步二等獎1項，省科技進步二等獎11項，三等獎多項。2000年以來，學院獲國家自然科學基金項目11項，教育部基金項目1項以及50多項省級、廳級基金項目；先后共出版專著10多部，在國際權威刊物和國家一級學術刊物上發表論文的370余篇，其中被SCI引用的有100余篇。